Ao agendar um chkdsk (checagem de disco) para a reinicialização, muitas vezes acontece de a maquina ficar sempre rodando e não inicializando o sistema Operacional, para corrigir esse problema é necessário entrar com um LiveCd do Windows (ERD Commander) e editar o registro, segue abaixo procedimento para desabilitar a checagem de disco na inicialização: Clique em Iniciar, em Executar, digite regedit e clique em OK.
Localize e clique na seguinte chave do Registro: HKEY_LOCAL_MACHINE\System\CurrentControlSet\Control\Session Manager\BootExecute
No menu Editar, clique em Modificar.
Altere de autocheck autochk/* para autocheck autochk*
e pressione ENTER.
Aviso O uso incorreto do Editor do Registro pode causar sérios problemas que talvez exijam a reinstalação do sistema operacional. A Microsoft não garante que os problemas resultantes do uso incorreto do Editor do Registro possam ser solucionados. O uso do Editor do Registro é de sua responsabilidade.
Fonte: http://support.microsoft.com/kb/831426
